Горячее
Лучшее
Свежее
Подписки
Сообщества
Блоги
Эксперты
#Круги добра
Войти
Забыли пароль?
или продолжите с
Создать аккаунт
Я хочу получать рассылки с лучшими постами за неделю
или
Восстановление пароля
Восстановление пароля
Получить код в Telegram
Войти с Яндекс ID Войти через VK ID
Создавая аккаунт, я соглашаюсь с правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.
ПромокодыРаботаКурсыРекламаИгрыПополнение Steam
Пикабу Игры +1000 бесплатных онлайн игр Классический пинбол, как в древнем игровом автомате или в компактной игрушке: есть пружины, шарики и препятствия. В нашем варианте можно не только зарабатывать очки: чтобы пройти уровень, придется выполнить дополнительную миссию.

Пинбол Пикабу

Аркады, На ловкость, Казуальные

Играть

Топ прошлой недели

  • SpongeGod SpongeGod 1 пост
  • Uncleyogurt007 Uncleyogurt007 9 постов
  • ZaTaS ZaTaS 3 поста
Посмотреть весь топ

Лучшие посты недели

Рассылка Пикабу: отправляем самые рейтинговые материалы за 7 дней 🔥

Нажимая кнопку «Подписаться на рассылку», я соглашаюсь с Правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.

Спасибо, что подписались!
Пожалуйста, проверьте почту 😊

Помощь Кодекс Пикабу Команда Пикабу Моб. приложение
Правила соцсети О рекомендациях О компании
Промокоды Биг Гик Промокоды Lamoda Промокоды МВидео Промокоды Яндекс Директ Промокоды Отелло Промокоды Aroma Butik Промокоды Яндекс Путешествия Постила Футбол сегодня
0 просмотренных постов скрыто
14
Vselenziaurum
Vselenziaurum
17 дней назад
Все о медицине
Серия NooMed

Учёные заморозили время в клетках с точностью до миллисекунд⁠⁠

Учёные заморозили время в клетках с точностью до миллисекунд Биология, Универ, Осака, Наука, Открытие, Микроскопия, Клетка, Исследования, Белка, Сердце, Технологии, Криогенная заморозка, Биофизика, Ученые

Японские исследователи разработали метод крио-оптической микроскопии, позволяющий фиксировать живые клетки в строго заданный момент времени с точностью до ±10 миллисекунд. Уникальная техника даёт возможность рассматривать стремительные биологические процессы так, словно они остановлены на кадре высокого качества.

Учёные показали метод на сердечных клетках новорождённых крыс, замораживая распространение волн кальция — процессов, происходящих всего за доли секунды. Благодаря такой «паузе» биологи получают возможность в тысячекратном увеличении рассматривать события, которые ранее было невозможно зафиксировать.

В перспективе технология может применяться для изучения фолдинга белков, работы ферментов и других быстротекущих реакций. Интеграция метода с другими видами микроскопии открывает дорогу к созданию комплексных систем, способных раскрыть тайны клеточной жизни на принципиально новом уровне.

Показать полностью 1
[моё] Биология Универ Осака Наука Открытие Микроскопия Клетка Исследования Белка Сердце Технологии Криогенная заморозка Биофизика Ученые
1
10
Aeremin
5 месяцев назад
Наука | Научпоп

МЕМЫ ФИЗИКИ И ФИЗИКА МЕМОВ: НЕЙРОФИЗИКА И ПСИХОФИЗИКА ИНТЕЛЛЕКТА⁠⁠

При сложной проблеме измерений мемов и распространения мемов физики с помощью образования, предприняты попытки математического, графического моделирования. Анализируются опыты появления во времени мемов — единиц физической науки, информации значимой для культуры и образования. Рассматривается в психофизике - математическая физика области умственных функций. Анализируются в нейрофизике нейрокорреляты интеллектуальных функций в мозге, регистрируемые методами медицинской физики. Предлагаются возможные перспективные подходы и приемы в образовании и педагогике на базе нейрофизики, психофизики, меметики, мнемотехник.

Еремин А.Л., Гассий М.В. Мемы физики и физика мемов: нейрофизика и психофизика интеллекта. В кн. Современные проблемы физики, биофизики и инфокоммуникационных технологий. Краснодар: ЦНТИ, 2024. С.5-27. https://www.researchgate.net/publication/390160935_MEMES_OF_...

МЕМЫ ФИЗИКИ И ФИЗИКА МЕМОВ: НЕЙРОФИЗИКА И ПСИХОФИЗИКА ИНТЕЛЛЕКТА Исследования, Наука, Научпоп, Физика, Мемы, Психофизика, Эволюция, Биофизика, Интеллект, Образование, Педагогика, Длиннопост

Появление мема физики и его запоминание следующими поколениями мнемотехническим методом повторения первоначального мыслительного эксперимента  (на примерах физиков и их открытий, имевших важное значение в фундаментальной физике)

МЕМЫ ФИЗИКИ И ФИЗИКА МЕМОВ: НЕЙРОФИЗИКА И ПСИХОФИЗИКА ИНТЕЛЛЕКТА Исследования, Наука, Научпоп, Физика, Мемы, Психофизика, Эволюция, Биофизика, Интеллект, Образование, Педагогика, Длиннопост

Модели распространения мемов в популяции:динамики их эволюции во времени, запоминания/забывания поколениями, "мемы важных знаний", "взлет и падение мемов", "инфопандемия мема".

Показать полностью 2
[моё] Исследования Наука Научпоп Физика Мемы Психофизика Эволюция Биофизика Интеллект Образование Педагогика Длиннопост
1
1207
Fosuerk
Fosuerk
1 год назад

Нанокиборги⁠⁠

В Институте Биофизики в Венгрии запилили нанокиборгов. Вот тут на видео видно, как один поймал клетку специальным зажимом и пошел толкаться с другим таким же. Все болезни будут побеждены! Чувствую, ковид нам скоро покажется веселым детским праздником.

Биофизика Наноботы Живая клетка Видео Без звука
180
24
Aeremin
1 год назад
Серия Медицинская физика и биофизика интеллекта

Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024)⁠⁠

Новая книга должна выйти в августе в издательстве Санкт-Петербург: Лань.

Впервые, используется метод "наблюдателя" к рассмотрению интеллекта и интеллектуальных систем с различны точек отсчета и ракурсов, в разных системах координат и размерных шкалах.

Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост

Препринт доступен https://www.researchgate.net/publication/382393268_Biophysic...

https://vk.com/id709845533?w=wall709845533_77/all

Автор был бы благодарен за любые замечания, уточнения по совершенствованию пособия, рекомендации, отзывы, присланные на адрес: aeremin@yandex.ru

Оглавление

ГЛАВА 1. ИНТЕЛЛЕКТ ФИЗИКА УЧЕНОГО-ИССЛЕДОВАТЕЛЯ – наблюдатель изнутри собственного интеллекта
1.1. Актуальность "наблюдателя" в научном методе физики
1.2. Попытки и подходы физиков к параметрам, величинам, характеристикам интеллекта
1.3. Наблюдатель изнутри собственного интеллекта
ГЛАВА 2. ФИЗИКА ЕСТЕСТВЕННОГО ИНТЕЛЛЕКТА
2.1. Наблюдатель снаружи интеллект-системы человека
2.2. Развертка интеллект-систем во времени
ГЛАВА 3. ФИЗИКА СИГНАЛОВ НОСИТЕЛЕЙ ИНФОРМАЦИИ
3.1. Физические сигналы и материальные носители информации, единицы измерений, параметры
3.2. Физика восприятия-обработки-накопления-производства информации и интеллектуального труда
ГЛАВА 4. МАТЕМАТИЧЕСКАЯ ФИЗИКА ИНТЕЛЛЕКТА
ГЛАВА 5. БИОНИКА ИСКУССТВЕННОГО ИНТЕЛЛЕКТА
5.1. Некоторые современные тренды ИИ и информационно-коммуникационных технологий
5.2. От нерешенных проблем бионики интеллекта и обратной сборки мозга к стратегиям разработок ИИ
ГЛАВА 6. МАКРО-ИНТЕЛЛЕКТ СИСТЕМА ЧЕЛОВЕЧЕСТВА - наблюдатель изнутри и снаружи
6.1. Развертка макро-интеллект-системы человечества во времени
6.2. Коллективный интеллект популяции человечества - наблюдатель изнутри
6.3. Наблюдатель снаружи макро-интеллект-системы человечества
ГЛАВА 7. АСТРОФИЗИКИ В ПОИСКЕ ВНЕЗЕМНОГО ИНТЕЛЛЕКТА

Изображения к главам научно-популярного издания автором сгенерированы с помощью общедоступного нейросетевого искусственного интеллекта Midjourney ИИ.

Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Биофизика интеллекта и физика интеллектуальных систем (2024) Наука, Эволюция, Научпоп, Ученые, Исследования, Интеллект, Физика, Биология, Астрофизика, Цивилизация, Ноосфера, Seti, Коллективный разум, Искусственный интеллект, Астробиология, Наблюдатели, Биофизика, Система, Длиннопост
Показать полностью 10
[моё] Наука Эволюция Научпоп Ученые Исследования Интеллект Физика Биология Астрофизика Цивилизация Ноосфера Seti Коллективный разум Искусственный интеллект Астробиология Наблюдатели Биофизика Система Длиннопост
1
24
PNIPU
PNIPU
1 год назад
Наука | Научпоп

Как диагностируют рак врачи и биофизики — рассказали ученые Пермского Политеха⁠⁠

Как диагностируют рак врачи и биофизики — рассказали ученые Пермского Политеха Научпоп, Ученые, Наука, Рак и онкология, Биофизика, Медицина, Диагностика, Компьютерное моделирование, Длиннопост

Фото: freepik

Ученые Пермского Политеха рассказали, что повышает риск развития онкозаболевания, какие есть методики обнаружения рака, кому следует чаще проходить обследования и почему стоит быть внимательным к своему самочувствию, а также объяснили, как на основе модели нескольких пораженных клеток распознать разновидность рака.

Раковые (злокачественные) клетки — это клетки практически любых тканей организма, которые приобрели способность к бесконтрольному быстрому делению и утрате своих функций. Питаются такие клетки тем же, чем и обычные. При этом из-за интенсивного роста они перехватывают питательные вещества, предназначенные для здоровых клеток ткани, таким образом угнетая их. В результате развивается новообразование, уничтожающее орган, в котором растет. Например, при раке легкого вместо ткани формируется опухоль, состоящая из злокачественных клеток, которые утрачивают способность к полноценному воздухообмену. Из-за этого нарушается подача кислорода в кровь, сильно ухудшается самочувствие человека.

Почему рак — коварное заболевание?

Об этом рассказал Сергей Солодников, кандидат медицинских наук, научный консультант по вопросам фармакологии НОЦ ХимБИ ПНИПУ. Рассмотрим на примере опухоли мочевого пузыря (карциномы). Она поражает внутреннюю оболочку пузыря, растет в объеме и переходит на кровеносные сосуды, что приводит к кровотечению и к возможности метастазирования — процесса, при котором злокачественные клетки попадают в другие органы, где также возможно развитие опухоли. Это один из вариантов развития событий.

Другой путь — опухоль не повреждает кровеносные сосуды и при этом никак себя не проявляет. Однако занимает большой объем внутри органа, в результате чего нарушается процесс мочеотделения. Третий вариант — опухоль прорастает в глубжележащие ткани, например, в мышечную, и нарушает ее функции, что также ухудшает выведение мочи. При втором и третьем варианте диагностика опухоли будет затруднена, так как нарушение функций мочевого пузыря будет проявляться только на поздних стадиях развития рака. Кроме того, рак может развиваться и другими способами, кроме приведенных.

Откуда берутся злокачественные клетки?

— Интересно, что процесс мутации клеток в раковые в нашем организме происходит постоянно. Однако этот процесс контролируется нашей иммунной системой, так как злокачественная клетка является антигеном — чужеродным веществом, которое необходимо уничтожить. Предрасположенность к мутации клеток передается на генетическом уровне, — рассказывает Сергей Солодников.

Механизм развития рака в настоящее время продолжают изучать. Установлены вещества, способные «испортить» здоровые клетки и трансформировать их в опухоль. Они называются канцерогенами и содержатся в табачном дыме, алкоголе, многократно используемом растительном масле при обжаривании, например, котлет или пирожков, в различных растворителях и т.д.

В некоторых случаях опухоль развивается, когда иммунитет перестает справляться с постоянно формирующимися раковыми клетками. К иммунной депрессии может привести стресс, хроническое недосыпание, вредные привычки, несбалансированное питание. Важную роль играет состояние экологии, угнетают иммунитет смог и промышленные выбросы в воздухе, некачественная вода. В ослабленном состоянии защитная система организма может находиться из-за заболеваний, например, лучевой болезни, иммунодефицитов, вирусных заболеваний отдельных органов, например, мочеполовой системы, и др.

Как обнаружить рак?

— Онкозаболевания часто диагностируются на поздних стадиях, когда помочь больному очень тяжело или просто невозможно. И поэтому одним из основных способов заподозрить развитие рака является правильная и объективная оценка своего состояния. Например, появление быстрой утомляемости, незначительное спонтанное повышение температуры (37,0-37,2 градусов), изменение массы тела и другие симптомы на фоне длительного стресса, недосыпания, нерегулярного питания, — объясняет ученый-медик Пермского Политеха.

Следующий этап выявление онкологии — это анализы, общие и специфические. Общий и биохимический анализы крови и мочи, к сожалению, малоинформативны на первых стадиях развития онкозаболевания. Но в купе с жалобами больного это может помочь в ранней диагностике опухоли. Наиболее точная диагностика — анализы на наличие онкомаркеров: РЭА — маркер рака ЖКТ, ПСА — маркер рака предстательной железы, СА 15-3 — маркер рака молочной железы и др. Используют и аппаратные методы диагностики: рентгенологическое обследование, ультразвуковая диагностика, различные виды томографии.

Кому следует регулярно проходить обследования?

Периодически проверяться на наличие онкозаболеваний стоит каждому человеку. Особенно — если вы замечаете ухудшение самочувствия: следует обратиться к врачу и уточнить необходимость обследования.

В группе риска оказываются люди, которые систематически контактируют с канцерогенами, например, задействованные на вредном производстве. Чаще прочих специалисты советуют проверяться тем, кто имеет вредные привычки: например, если стаж табакокурения превышает пять лет, у человека возможно развитие рака легких и мочевого пузыря, в данном случае можно использовать анализы на наличие онкомаркеров или регулярно проводить аппаратные обследования — узи. Предрасположенность к развитию рака имеют люди с такими хроническими заболеваниями, как сахарный диабет, гипоацидный гастрит, хронический гепатит, панкреатит и др. График обследований необходимо обсуждать с врачом. Для людей старше 60 лет область исследований на наличие возможных онкозаболеваний зависит от анамнеза и должна быть рекомендована врачом.

Опухоль — это орган? Взгляд ученого биофизика

— Многие исследователи рассматривают раковую опухоль как орган, так как она в ходе своей эволюции приобретает структурную форму и обладает функциями и способностями к росту и распространению. Аргументы в пользу этого мнения включают в себя способность опухоли взаимодействовать с окружающей тканью, «маскироваться» от иммунной системы, создавать собственное кровоснабжение и вырабатывать сигнальные молекулы, способствующие росту опухоли и влияющие на организм в целом. В наших работах мы придерживаемся такой точки зрения, — объясняет Иван Красняков, кандидат физико-математических наук, старший преподаватель кафедры прикладной физики ПНИПУ.

Как в Пермском Политехе прогнозируют развитие рака

Получать информацию из биологических систем стало возможно относительно недавно, когда ученым удалось выделить ген флуоресцентного (светящегося) белка — GFP, и встроить его в биологическую систему. Именно так получилось наблюдать в микроскоп синтез белка: изменение его концентрации, каким образом и куда он распределялся, его деградацию и т.д. Данные, полученные на основе такого наблюдения, возможно описать в виде математических выражений, — то есть представить биологический процесс в виде формул и моделей.

— Довольно большой круг лиц занимается математическим моделированием развивающихся биологических систем. А вот в области математического моделирования развития злокачественных образований выделяются следующие исследователи: Pismen L. (Хайфа, Израиль), Колобов А.В. (Москва, Россия) и команда Пермского Политеха, — рассказывает ученый-биофизик ПНИПУ.

На сегодня существует два основных подхода к разработке математических моделей онкологических заболеваний. Первый основан на механике сплошных сред, второй – дискретный подход. Дискретный подход объединяет в себе клеточные автоматы — модель, в которой состояние ячеек-клеток изменяется в зависимости от окружающих ее клеток, модели сферических частиц, вершинные модели, модели деформируемой клетки.

— Этот подход позволяет учитывать индивидуальную динамику элементов всей системы в целом. Используя дискретный подход, становится возможным исследовать процессы, присущие единичным клеткам во всей опухоли. Например, можно учитывать эпителиально-мезенхимальный переход раковых клеток — это процесс, при котором эпителиальная клетка, до этого плотно скрепленная с другими, отсоединяется и начинает перемещаться по ткани. Рассматривается также синтез белков, влияющих на способность здоровых клеток соединяться друг с другом, и др. Наша модель предполагает, что уже есть раковая клетка, которая начинает свое развитие. Работа направлена на прогнозировании архитектурной формы раковой опухоли при её развитии, — объясняет Иван Красняков.

Как это выглядит технически?

Команда ученых ПНИПУ создала модель развития карциномы — злокачественной опухоли, вырастающей из эпителиальной ткани, например, в легких, печени, почках, молочных железах. При этом карцинома бывает нескольких видов, каждый из которых имеет свою архитектурную форму. Чтобы спрогнозировать развитие опухоли, нужно в специальной программе создать модель эпителия из нескольких тысяч клеток, в котором находится одна раковая клетка. С помощью математических формул возможно определить форму клеток, их движение, положение внутри карциномы, а также обозначить различие в поведении между раковыми и здоровыми клетками. Таким образом, можно получить изображение уже развившейся карциномы и, сверив ее с фотографиями срезов различных видов опухолей, используемых Всемирной организацией здравоохранения, определить разновидность карциномы. Это ускорит постановку диагноза.

Также группой ученых ПНИПУ был разработан алгоритм, который позволяет проводить автоматическую классификацию карциномы. В теории этот алгоритм возможно применять к реальным изображениям гистологических срезов. Для этого его нужно усовершенствовать, решив трудоемкие задачи, связанные с предобработкой изображений, отмечает ученый-биофизик ПНИПУ.В медицине такие технологии внедряются и совершенствуются, они помогают врачу уменьшить время постановки правильного диагноза, что является важной задачей в клинической онкологии.

Показать полностью
[моё] Научпоп Ученые Наука Рак и онкология Биофизика Медицина Диагностика Компьютерное моделирование Длиннопост
0
Programma.Boinc
Programma.Boinc
2 года назад

Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект⁠⁠

Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект

Боумен возглавляет международный суперкомпьютерный проект Краудсорсинговая компьютерная сеть и исследует структуру белка и ищет новые методы лечения болезней.

Грег Боуман, доктор философии, доцент кафедры биохимии и молекулярной биофизики Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе, возглавляет суперкомпьютерный проект под названием Folding@home. Проект направлен на разгадку тайн динамики белков, включая процесс сворачивания, и их роль в здоровье и болезни.

Когда Грег Боуман представляет слайд-шоу о белках, которые он изучает, их трехмерные формы и узоры складывания воспроизводятся как анимация на большом экране. Когда он описывает эти молекулы, может быть легко упустить тот факт, что он не может видеть свою собственную презентацию, по крайней мере, не так, как это видят зрители. Боуман, официально признан слепым.

Кроме того, сейчас он возглавляет один из крупнейших в мире проектов по вычислительной биологии, основанный на краудсорсинге. Усилия направлены на то, чтобы понять, как белки принимают правильную форму, и какие структурные движения они претерпевают, выполняя свою работу по поддержанию здоровья тела.

Белки являются жизненно важными клеточными механизмами, и понимание того, как они собираются и функционируют — или неправильно функционируют — может пролить свет на многие из самых неприятных проблем в медицинской науке, от предотвращения болезни Альцгеймера до лечения рака и борьбы с устойчивостью к антибиотикам.

Проект, получивший соответствующее название Folding@home, опирается на мощность десятков тысяч домашних компьютеров для выполнения сложных вычислений, необходимых для моделирования динамики белков, которые изучают Боумен и его коллеги.

С такой сетевой вычислительной мощностью Folding@home, по сути, является одним из крупнейших в мире суперкомпьютеров. «Есть некоторые приверженцы традиционных суперкомпьютеров, которые могут не согласиться с такой характеристикой, — со смехом сказал Боуман.

«Folding@home — это не одна массивная машина, а распределенная вычислительная сеть. Тысячи добровольцев по всему миру загружают наше программное обеспечение и вносят свой вклад в проект на своих домашних компьютерах. Но с точки зрения чистой вычислительной мощности — количества вычислений, которые он может выполнять в секунду — он находится на одном уровне с самыми большими суперкомпьютерами в мире».

Боуман начал эту работу в лаборатории основателя Folding@home Виджая Панде, доктора философии, из Стэнфордского университета. Боумен получил докторскую степень в Стэнфорде и проводил там постдокторские исследования. После 18 лет у руля Панде выбрал Боумана, чтобы он возглавил компанию, благодаря чему Folding@home появился в следующем десятилетии и далее.

Команда Боумена использует распределенную вычислительную сеть, чтобы сделать масштабные вычислительные задачи более управляемыми. Сложная проблема, которую невозможно решить на одной машине, может быть разбита на более мелкие части и распределена на 1000 компьютеров для одновременного решения.

«У Грега уникальное сочетание навыков, — сказал Панде. «У него есть технические навыки, чтобы возглавить этот сложный проект, и у него есть навыки работы с людьми, чтобы управлять его распределенным характером, особенно учитывая тот факт, что в нем задействовано так много разных людей — как ученых, так и неученых. У Грега также есть прекрасное видение будущего этого проекта. Он не только будет следить за тем, чтобы задания шли вовремя, у него есть четкое представление о том, каким должен быть Folding@home через 10–20 лет».

Огромные вычислительные мощности Folding@home имеют решающее значение для понимания сворачивания белков — проблемы, которую Боуман называет классической грандиозной задачей в биохимии и биофизике.

Белки – это сырье, из которого состоит наш организм. Но они также являются молекулярными машинами, которые выполняют работу по созданию этих тел и обеспечивают их правильную работу. Чтобы выполнять свою работу, белок должен принять правильную форму. Если это не так, что-то пойдет не так. Боуман понимает это больше, чем большинство. Рожденный с нормальным зрением, Боумен постепенно терял зрение и к 9 годам официально стал слепым из-за наследственного заболевания, называемого болезнью Штаргардта. Форма ювенильной дегенерации желтого пятна возникает, когда белок, удаляющий отходы из клеток сетчатки, неправильно сворачивается и не может выполнять свою работу. В результате светочувствительные клетки сетчатки переполняются отходами и умирают, вызывая потерю центрального зрения.

Команда Грега Боумена слушает презентацию на собрании своей лаборатории.

Боуман сказал, что этот опыт пробудил страсть к биологии и стремление понять, что происходит, когда белки, на которые опирается наше тело, не работают должным образом. В конечном счете, он хотел бы найти способы исправить их. Но, будучи молодым студентом, Боумен быстро понял, что его путь в поле может выглядеть немного иначе, чем у обычного биолога. «Я узнал, что экспериментальная биология не очень доступна для людей с нарушениями зрения», — сказал Боуман. «По сути, я вижу в низком разрешении, в основном боковым зрением. Я могу ориентироваться в коридорах и лабораториях, но, например, я не могу читать по маленькому циферблату на пипетке.

«Когда я понял это, я также влюбился в компьютеры», — сказал он. «Я увидел, что навыки информатики и математического моделирования можно применить к биологическим проблемам.

Кроме того, одна из многих прелестей компьютеров заключается в том, что их действительно легко увеличивать. Я могу увеличивать изображение в 16 раз и прокручивать экран, чтобы читать научную статью или даже просто электронное письмо».

С помощью Folding@home Боуман и его коллеги изучают белки и то, как они складываются более чем в 16 раз. Действительно, они приближаются настолько, насколько это физически возможно — вплоть до атомного уровня. С помощью этого объединенного в сеть суперкомпьютера ученые могут моделировать белки на уровне отдельных атомов за долю времени, которое потребовалось бы даже для мощных одиночных компьютеров.

Многие важные биологические процессы, которые выполняют белки, происходят от миллисекунд до нескольких секунд. Это может показаться коротким, но для измерения атомов, когда они отскакивают друг от друга, требуется шкала времени в фемтосекундах — одна квадриллионная доля секунды. «Чтобы смоделировать свертывание всего за одну миллисекунду, даже для белка среднего размера, на первоклассном MacBook Pro потребуется около 500 лет», — сказал Боуман. «Но с помощью Folding@home мы можем разделить эти проблемы на множество независимых частей. Мы можем отправить их до 1000 человек одновременно. Выполняя эти расчеты параллельно, мы можем взять эти проблемы, на решение которых ушло бы 500 лет, и вместо этого решить их за шесть месяцев».

На момент написания этой статьи у Folding@home было более 110 000 добровольных участников по всему миру, которые поделились частью своих домашних вычислительных мощностей. Судя по видеороликам некоторых волонтеров, их причины для участия в проекте, как и у Боумена, личные. Программа дает пользователям некоторый выбор в том, в какие проекты они вносят свой вклад, заинтересованы ли они, среди прочего, в расширении исследований рака, предотвращении болезни Альцгеймера или борьбе с устойчивостью к антибиотикам.

Мэтью Круз, аспирант лаборатории Боумена, выступает с докладом на собрании лаборатории. Команда Боумена использует вычислительную мощность Folding@home для изучения того, как бактерии вырабатывают устойчивость к антибиотикам, и ищет способы борьбы с растущей угрозой лекарственно-устойчивых микробов.

Боуман предвидит будущее, в котором Folding@home станет отправной точкой для разработки новых лекарств. Прямо сейчас ученым часто приходится изучать только одну хорошо известную белковую структуру. Например, бета-лактамаза — это белок, который некоторые бактерии используют для защиты от антибиотиков, таких как пенициллин.

Белок имеет хорошо задокументированную, давно изученную структуру. Но эта структура представляет собой только один снимок бета-лактамазы в один момент времени. «Этот снимок содержит ценную информацию, — сказал Боуман.

«Но это все равно, что увидеть фото строительной машины на стоянке и попытаться угадать, что она делает. На самом деле, вам бы хотелось понаблюдать за тем, как эта штука двигается, и увидеть, как она работает вместе с другими механизмами, чтобы, скажем, построить здание.

Нам интересно наблюдать за тем, как движется каждый атом в белке — когда он впервые собирается и выполняет свою работу. Атомы в белке никогда не стоят на месте, они постоянно толкаются и перемещаются.

И одна генетическая мутация изменяет, может быть, дюжину атомов из тысячи. Мы хотим понять, что это делает со всем белком». Среди нескольких проектов собственная лаборатория Боумена использует Folding@home для поиска новых лекарств для борьбы с устойчивостью к антибиотикам.

Наблюдение за движением бета-лактамазы, например, уже выявило то, что Боумен называет «скрытыми карманами» — слабыми местами в белке, на которые могут воздействовать лекарства, но которые не видны на давно изученном снимке этого белка. Скрытые карманы обнаруживаются только тогда, когда белок движется. Поскольку Боумен видит мир немного иначе, чем большинство людей, Folding@home предлагает ученым другой взгляд на давно изучаемые белки, раскрывая решения биологических проблем, которые в противном случае могли бы остаться скрытыми от глаз. Чтобы заставить свой компьютер складывать белки, посетите веб-сайт Folding@home.

Боумен и сотрудники его лаборатории используют компьютеры для моделирования динамики белков, исследования, которые имеют значение для понимания и, возможно, лечения многих типов заболеваний. Исследователи приглашают гражданских ученых присоединиться к их усилиям, добровольно поделившись частью вычислительных мощностей своих домашних компьютеров. Посетите foldathome.org для получения дополнительной информации.

https://foldingathome.org/start-folding/

https://biochem.wustl.edu/faculty/bowman

https://medicine.wustl.edu/news/bowman-leading-international-supercomputing-project/

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:

https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view

https://boinc.berkeley.edu/download_all.php

https://boinc.ru

Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.

https://github.com/BOINC/boinc

Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект Биохимия, Биофизика, Наука, Волонтерство, Длиннопост
Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект Биохимия, Биофизика, Наука, Волонтерство, Длиннопост
Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект Биохимия, Биофизика, Наука, Волонтерство, Длиннопост
Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект Биохимия, Биофизика, Наука, Волонтерство, Длиннопост
Показать полностью 4
Биохимия Биофизика Наука Волонтерство Длиннопост
4
14
kek2015
3 года назад

Сеченов или Пирогов: Куда лучше поступать?⁠⁠

Спасибо всем, кто несколько месяцев назад советовал книги и ресурсы по химии! ЕГЭ сдан, впереди ДВИ на химфак, но вот вопрос:
Если выбирать между биофизикой (интересует не лечфак, а именно исследовательская медицина) в 1-м и 2-м меде, что бы вы выбрали?
Где выше уровень образования?
Где интереснее учиться?
Подводные камни (коррупция, пофигизм преподов итп)?
Очень прошу откликнуться пикабушников из Сеченовки и Пироговки!
Всем спасибо, всем абитуриентам этого года удачи!

Сеченов или Пирогов: Куда лучше поступать? Медицинский университет, Биофизика, Учеба, Поступление в вуз
Показать полностью 1
[моё] Медицинский университет Биофизика Учеба Поступление в вуз
5
3
Aeremin
3 года назад
Искусственный интеллект

Эволюция интеллектуальных систем⁠⁠

"Ноогенез - эволюция интел-систем: развертка скорости коммуникаций (~100 м/с - 300 млн м/с); квантификация количества компонентов интеллектуальных систем (10-100 млрд); подсчет связей, обеспечивающих кооперацию (от 150 до 1 трлн связей)..."

Статья в "Биофизика" - Российской академии наук, 2022

https://www.researchgate.net/publication/358843061_K_biofizike_evolucii_intellektualnyh_sistem

Эволюция интеллектуальных систем Наука, Исследования, Ученые, Интеллект, Ноосфера, Эволюция, Искусственный интеллект, Биофизика, Нейронные сети, Коллективный разум
[моё] Наука Исследования Ученые Интеллект Ноосфера Эволюция Искусственный интеллект Биофизика Нейронные сети Коллективный разум
0
Посты не найдены
О нас
О Пикабу Контакты Реклама Сообщить об ошибке Сообщить о нарушении законодательства Отзывы и предложения Новости Пикабу Мобильное приложение RSS
Информация
Помощь Кодекс Пикабу Команда Пикабу Конфиденциальность Правила соцсети О рекомендациях О компании
Наши проекты
Блоги Работа Промокоды Игры Курсы
Партнёры
Промокоды Биг Гик Промокоды Lamoda Промокоды Мвидео Промокоды Яндекс Директ Промокоды Отелло Промокоды Aroma Butik Промокоды Яндекс Путешествия Постила Футбол сегодня
На информационном ресурсе Pikabu.ru применяются рекомендательные технологии