Современное здание Московской духовной консистории построено в 1890-х годах прошлого века по проекту архитектора В.Г. Сретенского. Но земля, на которой стоит особняк в русском стиле, имеет намного более глубокую и темную историю, чем мы привыкли думать.
В XV веке здесь находились палаты Годуновых, а чуть позже постройки Рязанского подворья. Именно в них Петр I открыл свою Тайную канцелярию. Позже Екатерина II разместила здесь похожий орган — тайную экспедицию при Сенате.
При сносе зданий в конце XIX века открылся темный секрет организации. Выяснилось, что в подвалах построек находились тайные казематы, где содержали подсудимых, обвиняемых в преступлениях против власти. По свидетельствам Гиляровского, в замурованных подземельях нашли множество цепей и человеческих костей. Оказалось, что в этих подвалах содержали Емельяна Пугачева, допрашивали писателя Николая Новикова, судили Салтычиху.
В 1833 году бывшие правительственные помещения занимает духовенство. Именно оно сносит старые здания и оплачивает постройку нового особняка. В нем разместили меблированные комнаты для сдачи в аренду и контора «Мазуринской биржевой артели». В одном из помещений на первом этаже открывает магазин хрусталя предприниматель Юрий Степанович Нечаев-Мальцев.
После революции помещения здании делили библиотека, редакционный комитет «Технико-экономического общества» и книжный магазин государственных технических издательств.
Сегодня в особняке располагается Следственный департамент МВД России.
