shinjik

Один из самых неуловимых диких котов на планете, он процветает в некоторых из самых экстремальных сред на Земле. Но что мы на самом деле знаем об их генетике, адаптациях и потребностях в охране? До недавнего времени -- не так уж много. Теперь геномика помогает разгадать историю этого загадочного степного жителя.

В 2023 году исследователи из Университета Миннесоты секвенировали первый в мире геном манула . В этом исследовании мне бросились в глаза две вещи: во-первых, исследователи использовали коренное название «манул», а не западное «палласов кот» и, во-вторых, они раскрыли особь, чью ДНК они секвенировали — Тейтер (или Тейт, как его называют многие).

Итак, что же они обнаружили? Для начала, команда создала одну из самых качественных сборок генома для любой дикой кошки того времени (молодец, Тейт, ты знаменит!). Они также обнаружили, что у манулов низкий уровень гетерозиготности — это означает, что нет большой генетической разницы между ДНК, унаследованной от каждого родителя. Низкая гетерозиготность может повысить восприимчивость к болезням и снизить приспособляемость.

Исследование также показало, что манулы пережили бутылочное горлышко популяции около 3000 поколений назад, при этом эффективный размер популяции составлял около 10 000 особей. Так же, как и гепарды, чьи предки столкнулись с резким сокращением численности в конце ледникового периода, численность манулов, вероятно, сократилась из-за климатических изменений, прежде чем снова стабилизировалась. Эти бутылочные горлышки сокращают генетическое разнообразие, что может ограничить способность вида адаптироваться к изменениям окружающей среды в будущем.

У манулов это может иметь долгосрочные последствия для их устойчивости к болезням, изменениям среды обитания и другим угрозам. Чтобы лучше понять эти риски, учёные продолжили секвенировать дополнительные геномы, постепенно заполняя пробелы. Только в прошлом году другое исследование представило четыре новых генома манулов , доведя общее число до пяти! Это может показаться не таким уж большим достижением, но в мире геномики сохранения каждый новый геном добавляет критически важные идеи.

Эти исследователи подтвердили ранее наблюдаемую низкую гетерозиготность, но они также сосредоточились на конкретном гене — EPAS1, который связан с адаптацией к среде с низким содержанием кислорода. Оказывается, у манулов есть уникальная мутация в EPAS1, которая, вероятно, отвечает за их способность процветать на экстремальных высотах (до 5600 метров!). Этот же ген также связан с адаптацией к высоте у тибетских яков и гималайских волков.

Почему всё это имеет значение?
Потому что чем больше мы понимаем генетику манулов, тем лучше мы можем их защитить. Например, у содержащихся в неволе манулов высокие показатели смертности, часто из-за инфекционных заболеваний, таких как токсоплазмоз. Если генетические исследования смогут выявить генетические варианты, влияющие на иммунную функцию, зоопарки и программы по сохранению животных смогут принимать решения по разведению, которые улучшат устойчивость.

Более того, дополнительные геномы позволят учёным лучше оценить генетическое разнообразие в диких популяциях. Понимание того, какие популяции наиболее подвержены риску инбридинга (скрещивание в пределах одной популяции), может помочь экологам расставить приоритеты в усилиях по защите в дикой природе и направить лучшее генетическое управление в зоопарках.

Конечно, секвенирование генома — непростая задача. Она требует времени, финансирования, опытных исследователей и, что самое важное, биологических образцов. Сбор крови у манулов — непростая задача, а в некоторых случаях может быть стрессовым для животного ( и для исследователей ). К счастью, альтернативные методы отбора проб, такие как анализ экскрементов (да-да, какашек манула) или использование умерших особей, помогают учёным собирать ДНК, минимизируя риски.

Один большой вопрос, который у меня возник заключается в том, подтвердят ли (или опровергнут) генетические исследования предполагаемый подвид манулов. Если говорить кратко, манулы на всём своём обширном ареале — от Монголии до Ирана — демонстрируют видимые различия. Возьмём так называемых иранских манулов «Гарфилд», прозванных за свой яркий оранжевый мех. Вызваны ли эти различия генетикой или просто результатом факторов окружающей среды? Аналогично манулы в китайских зоопарках (знаменитости сами по себе) имеют отличительные черты лица — и некоторые задаются вопросом, распространены ли эти черты и среди диких тибетских манулов — что может указывать на особую тибетскую генетическую линию. Геномика может наконец дать ответы на эти вопросы.

Понимание того, действительно ли манулы разделены на отдельные подвиды, напрямую влияет на планирование сохранения и стратегии разведения. Если существуют отдельные линии, для сохранения генетического разнообразия может потребоваться отдельное управление.

Чем больше мы узнаем о геноме манула, тем лучше мы сможем сохранить этот вид для будущих поколений. Каждый новый секвенированный геном приближает нас к разгадке тайн этих неуловимых степных жителей, гарантируя, что они продолжат рыскать для будущих поколений.

(перевела с использованием онлайн переводчиков)

В настоящее время наблюдается тенденция к уменьшению отёка лица, но требуется постоянное лечение. Кроме того, с возрастом наблюдается снижение функции почек, и проводится регулярное лечение. Исходя из вышеизложенного, в результате консультаций между смотрителем зоопарка и ветеринаром было принято решение продолжить постоянное лечение на заднем дворе. Мы также решили назначить день, когда все желающие смогут встретиться со Львом в последний раз, но из-за физического состояния Лёвы мы пока оставим его на заднем дворе. С сожалением сообщаем об этом всем, кто с нетерпением ждал дня, когда вы сможете встретиться со Львом.

Источник (Nasu Animal Kingdom)

(перевела с использованием онлайн переводчиков)