shinjik

shinjik

Неудержимый фанат :3
Пикабушница
Дата рождения: 13 июня
khe.khe belov174
belov174 и еще 8 донатеров
683К рейтинг 264 подписчика 35 подписок 5307 постов 4287 в горячем
Награды:
За разумный выбор Городская легенда Внимательный пассажир Самый большой торт За киберзащиту За киноманство За самое странное содержимое портфеля За большую любовь к учителям Самый продвинутый факультет Стальная  угроза За успехи в мемологии Ежегодное приключениеПизанская ёлкаМакаронная статуяСкуфзаводЧайкам тут не место Самый экскурсионный факультет За рабочую энергию
42

Вкусный сюрприз к пробуждению

Вкусный сюрприз к пробуждению Дикие животные, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Манул, Малые кошки, Вольер, Мясо
Показать полностью 1
57

Утренние потягушки

Утренние потягушки
50

Молодость против опыта

Молодость против опыта
48

Взлом кода манула

Разгадывая генетические тайны степи.

(автор Pazi)

Знаете ли вы, что всего пару десятилетий назад секвенирование (метод определения нуклеотидной последовательности ДНК и РНК) одного генома занимало годы и стоило миллиарды долларов? Сегодня, благодаря быстрому развитию технологий, мы можем сделать это за несколько дней всего за тысячу долларов. И эта революция не просто меняет медицину человека — она трансформирует охрану дикой природы, давая нам беспрецедентные знания о видах, о которых мы когда-то мало что знали.

Например – манул.

Взлом кода манула Манул, Малые кошки, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Дикие животные, Исследования, ДНК, Повтор, Детеныш, Длиннопост, Текст

Дерсу в зоопарке Дессау

Один из самых неуловимых диких котов на планете, он процветает в некоторых из самых экстремальных сред на Земле. Но что мы на самом деле знаем об их генетике, адаптациях и потребностях в охране? До недавнего времени -- не так уж много. Теперь геномика помогает разгадать историю этого загадочного степного жителя.

В 2023 году исследователи из Университета Миннесоты секвенировали первый в мире геном манула . В этом исследовании мне бросились в глаза две вещи: во-первых, исследователи использовали коренное название «манул», а не западное «палласов кот» и, во-вторых, они раскрыли особь, чью ДНК они секвенировали — Тейтер (или Тейт, как его называют многие).

Взлом кода манула Манул, Малые кошки, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Дикие животные, Исследования, ДНК, Повтор, Детеныш, Длиннопост, Текст

Тейт в зоопарке Ютики, Нью-Йорк.

Итак, что же они обнаружили? Для начала, команда создала одну из самых качественных сборок генома для любой дикой кошки того времени (молодец, Тейт, ты знаменит!). Они также обнаружили, что у манулов низкий уровень гетерозиготности — это означает, что нет большой генетической разницы между ДНК, унаследованной от каждого родителя. Низкая гетерозиготность может повысить восприимчивость к болезням и снизить приспособляемость.

Исследование также показало, что манулы пережили бутылочное горлышко популяции около 3000 поколений назад, при этом эффективный размер популяции составлял около 10 000 особей. Так же, как и гепарды, чьи предки столкнулись с резким сокращением численности в конце ледникового периода, численность манулов, вероятно, сократилась из-за климатических изменений, прежде чем снова стабилизировалась. Эти бутылочные горлышки сокращают генетическое разнообразие, что может ограничить способность вида адаптироваться к изменениям окружающей среды в будущем.

У манулов это может иметь долгосрочные последствия для их устойчивости к болезням, изменениям среды обитания и другим угрозам. Чтобы лучше понять эти риски, учёные продолжили секвенировать дополнительные геномы, постепенно заполняя пробелы. Только в прошлом году другое исследование представило четыре новых генома манулов , доведя общее число до пяти! Это может показаться не таким уж большим достижением, но в мире геномики сохранения каждый новый геном добавляет критически важные идеи.

Эти исследователи подтвердили ранее наблюдаемую низкую гетерозиготность, но они также сосредоточились на конкретном гене — EPAS1, который связан с адаптацией к среде с низким содержанием кислорода. Оказывается, у манулов есть уникальная мутация в EPAS1, которая, вероятно, отвечает за их способность процветать на экстремальных высотах (до 5600 метров!). Этот же ген также связан с адаптацией к высоте у тибетских яков и гималайских волков.

Взлом кода манула Манул, Малые кошки, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Дикие животные, Исследования, ДНК, Повтор, Детеныш, Длиннопост, Текст

Реза в зоопарке Росс-Парка

Почему всё это имеет значение?
Потому что чем больше мы понимаем генетику манулов, тем лучше мы можем их защитить. Например, у содержащихся в неволе манулов высокие показатели смертности, часто из-за инфекционных заболеваний, таких как токсоплазмоз. Если генетические исследования смогут выявить генетические варианты, влияющие на иммунную функцию, зоопарки и программы по сохранению животных смогут принимать решения по разведению, которые улучшат устойчивость.

Более того, дополнительные геномы позволят учёным лучше оценить генетическое разнообразие в диких популяциях. Понимание того, какие популяции наиболее подвержены риску инбридинга (скрещивание в пределах одной популяции), может помочь экологам расставить приоритеты в усилиях по защите в дикой природе и направить лучшее генетическое управление в зоопарках.

Конечно, секвенирование генома — непростая задача. Она требует времени, финансирования, опытных исследователей и, что самое важное, биологических образцов. Сбор крови у манулов — непростая задача, а в некоторых случаях может быть стрессовым для животного ( и для исследователей ). К счастью, альтернативные методы отбора проб, такие как анализ экскрементов (да-да, какашек манула) или использование умерших особей, помогают учёным собирать ДНК, минимизируя риски.

Один большой вопрос, который у меня возник заключается в том, подтвердят ли (или опровергнут) генетические исследования предполагаемый подвид манулов. Если говорить кратко, манулы на всём своём обширном ареале — от Монголии до Ирана — демонстрируют видимые различия. Возьмём так называемых иранских манулов «Гарфилд», прозванных за свой яркий оранжевый мех. Вызваны ли эти различия генетикой или просто результатом факторов окружающей среды? Аналогично манулы в китайских зоопарках (знаменитости сами по себе) имеют отличительные черты лица — и некоторые задаются вопросом, распространены ли эти черты и среди диких тибетских манулов — что может указывать на особую тибетскую генетическую линию. Геномика может наконец дать ответы на эти вопросы.

Взлом кода манула Манул, Малые кошки, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Дикие животные, Исследования, ДНК, Повтор, Детеныш, Длиннопост, Текст

Гарфилд

Понимание того, действительно ли манулы разделены на отдельные подвиды, напрямую влияет на планирование сохранения и стратегии разведения. Если существуют отдельные линии, для сохранения генетического разнообразия может потребоваться отдельное управление.

Чем больше мы узнаем о геноме манула, тем лучше мы сможем сохранить этот вид для будущих поколений. Каждый новый секвенированный геном приближает нас к разгадке тайн этих неуловимых степных жителей, гарантируя, что они продолжат рыскать для будущих поколений.

Взлом кода манула Манул, Малые кошки, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Дикие животные, Исследования, ДНК, Повтор, Детеныш, Длиннопост, Текст

(перевела с использованием онлайн переводчиков)

Показать полностью 4
13

Уютность

Уютность Капибара, Дикие животные, Зоопарк, Детеныш, Уют, Грызуны
Показать полностью 1
50

Любопытной Варваре на базаре нос оторвали :3

Любопытной Варваре на базаре нос оторвали :3 Дикие животные, Зоопарк, Хищные животные, Семейство кошачьих, Манул, Малые кошки
Показать полностью 1
42

Официальная информация о Лёвушке

Сообщаем вам, что в настоящее время Лев не участвует в выставках, поскольку проходит курс лечения отёка лица.

Официальная информация о Лёвушке Манул, Зоопарк, Семейство кошачьих, Дикие животные, Малые кошки, Болезнь, Хищные животные, Длиннопост

В настоящее время наблюдается тенденция к уменьшению отёка лица, но требуется постоянное лечение. Кроме того, с возрастом наблюдается снижение функции почек, и проводится регулярное лечение. Исходя из вышеизложенного, в результате консультаций между смотрителем зоопарка и ветеринаром было принято решение продолжить постоянное лечение на заднем дворе. Мы также решили назначить день, когда все желающие смогут встретиться со Львом в последний раз, но из-за физического состояния Лёвы мы пока оставим его на заднем дворе. С сожалением сообщаем об этом всем, кто с нетерпением ждал дня, когда вы сможете встретиться со Львом.

Официальная информация о Лёвушке Манул, Зоопарк, Семейство кошачьих, Дикие животные, Малые кошки, Болезнь, Хищные животные, Длиннопост

Источник (Nasu Animal Kingdom)

(перевела с использованием онлайн переводчиков)

Показать полностью 1
291

Битва маленьких якодзун1

Отличная работа, все прочитано!