1. Установщик. Дистры с которыми я имею дело обычно EL и, гораздо реже, Ubuntu/Debian. Так вот. Удачи тому, кто хочет поставить второе на headless-сервер. У EL начиная с лохматых версий есть установка через VNC, достаточно ядру параметр подкинуть. Для Убунты нужно в обязательном порядке писать кикстарт, который для бубунты то еще отвратительное и плохо задокументированное говнище, подключаться через SSH и продолжать установку. Еще удачи тому, что захочет развернуть бездисковый сервер с Убунтой с загрузкой по iSCSI. В установщике с какой-то версии просто вырезали к херам эту опцию. В итоге опять кривой кикстарт, куча нелепых телодвижений для установки, и, самое главное, загрузки с iSCSI т.к. ванильная установка просто такого не знает. Форматы кикстартов у убунты и рхелов принципиально разные.
2. Средства настройки. Про уебищный update-initramfs в Ubuntu я вообще молчу. Сколько лет это говно уже сидит там, и только вот-вот его собираются сменить на нормальный dracut. С настройкой сети тоже зоопарк, Netplan, NetworkManager - вообще разные. Да, я в курсе, что можно в убунте НМ поставить, а в рхелах использовать cloud-init, но художественное выпиливание по дистрибутиву та еще задачас негарантированным результатом, а у нас есть ограниченное время на выполнения наших задач. Остальное расписывать мне лень. Просто приведу примеры. Apparmor vs SELinux, ufw vs firewalld, тысячи их. В итоге куча инструкций для одного дистра крайне слабо подходит для другого. Да, для человека с опытом это не будет невыполнимой задачей, но на это будет уходить куча времени, которое можно потратить с гораздо большей пользой.
3. Пакеты, библиотеки. В каждом дистре есть мэйнтейнеры пакетов. Который сбирают, тестируют и опакечивают софт и либы. Их можно собирать очень по разному. С поддержкой разных библиотек, разных фич. В итоге, один и тот же софт на разных дистрах может работать очень по разному.
И это я пробежался только по двум основным группам дистров - EL и Deb-based. А там внутри еще различий миллион, даже между Debian и Ubuntu. А еще ведь есть всякие Alpine, которые тоже достачно прочно свою нишу держат.
Так что да, в дистрах линукса творится полный зоопарк и это, местами, очень утомляет.