Группа была сформирована весной 2000 года Юхой Райвио и Паси Пасаненом, ранее игравшими в группе Plutonium Orange. Они репетировали несколько песен, одной из которых была "Through Her Silvery Body" с первого демо "Out Of This Gloomy Light".
В 2001 году к группе присоединились гитарист Маркус Ямсен, которого Райвио и Пасанен знали по предыдущим коллективам, и вокалист Микко Котамяки из Funeris Nocturnum, а вскоре после первой репетиции также басист Матти Хонконен и клавишник Алекси Мунтер.
Весной 2002 они начали готовить репертуар для своей первой демо-записи, выпущенной в январе 2003 года. Запись осуществлялась в студии Sam's Workshop совместно с Сами Кокко.
Через несколько месяцев после записи первого демо был подписан контракт с лейблом Firebox Records. В течение следующих трёх недель они записали свой дебютный альбом "The Morning Never Came". Альбом вышел 15 ноября и на нем были представлены(кроме новых песен) перезаписанные композиции с демо "Out Of This Gloomy Light".
В 2005 году сингл "Forgive Her..." занял 4-е место в списке в Finnish Top 20 Singles Chart в первую неделю релиза, и оставался в чарте 6 недель.24 августа 2005 года, Swallow The Sun выпустили свой второй альбом "Ghosts Of Loss". Этот альбом также вошёл в чарт, заняв восьмое место: между Гвен Стефани и System Of A Down.По сравнению с дебютным альбомом, этот в этом альбоме преобладание готик-метал. Некоторые композиции записаны под влиянием просмотра сериала "Твин Пикс"
В 2006 году был подписан контракт с Spinefarm Records. В том же году группа совершила небольшое концертное турне по Европе.
В январе 2007 года вышел третий альбом, "Hope", который включает в качестве бонуса кавер-версию песни Timo Rautiainen & Trio Niskalaukaus "Alavilla Mailla" (переведённую на английский и названную "These Low Lands"), которую исполнил Томи Йоутсен, фронтмен группы Amorphis. Этот трек вошел как бонус к диджипак-изданию альбома. Также в записи альбома принял участие Йонас Ренске из Katatonia, который поёт в песне "The Justice Of Suffering". В конце 2007 они отправились в турне по США вместе с Katatonia, Scar Symmetry и Insomnium.
В начале 2008 группа приступила к записи мини-альбома под названием "The Plague Of Butterflies", который был выпущен в сентябре того же года. Это 35-минутное демо, которое состоит из трёх треков, наполненных мраком, красотой и отчаянием. Этот релиз повествует о старом отшельнике, глубоких лесах, одиночестве и чуме. Ещё никогда группа не показывала свою полярность. Здесь есть всё: от криков отчаяния и до душераздирающих пассажей.
18 мая 2009 года группу покинул барабанщик Паси Пасанен, его место занял участник финской группы Wintersun, Кай Хахто (Kai Hahto). С июня по июль Swallow The Sun поводят три недели в Fascination Street Studios в Швеции со своим продюсером Йенсом Богреном, записывая свой четвёртый полноформатный альбом "New Moon". Релиз альбома состоялся в ноябре этого же года. На трек "Falling World" был снят видео-клип.
В апреле 2010 года группа отправляется в тур по Северной Америке вместе с Finntroll, Moonsorrow и Survivors Zero. Летом музыканты впервые посетили Израиль, а также приняли участие в румынском фестивале ARTmania, а осенью состоялся европейский тур с Sólstafir и Mar De Grises. По итогам этого года в рамках тура в поддержку "New Moon" было дано 146 концертов в 24 странах мира, включая два вояжа в Северную Америку.
Также музыканты объявили, что готовят материал для нового полноформатного альбома, релиз которого намечается на начало 2012 года. Вскоре группа отправилась в Drumforest Studios в Виитасаари, где при помощи легендарного звукоинженера Микко Кармила (Nightwish, Sentenced, Amorphis и Children Of Bodom начала запись "Emerald Forest And The Blackbird", который вышел 1 февраля 2012 года. 3 января 2012 года группа выпустила видеоклип на трек "Cathedral Walls" с гостевой вокалисткой Анетт Ользон.
В январе 2012 года Swallow The Sun анонсировали 21 шоу в Финляндии совместно с The Man-Eating Tree.
13 ноября 2015 года был выпущен тройной альбом "Songs From The North I, II & III". "Первый и самый длинный диск (59 минут 20 секунд) можно считать классическим для группы, которая на протяжении 15-летней карьеры играет печальный среднетемповый дум/дэт, традиционно приправленный мелодичными элементами. Второй альбом (42 минуты 33 секунды), лишенный даже намеков на суровые вокалы и тяжелые риффы, заполнен меланхолией, своего рода «фолковым» готик-роком и массой отсылок к ANATHEMA, GHOST BRIGADE и TIAMAT. Финальная часть (51 минута 57 секунд), как и было обещано в пресс-релизе, содержит очень тяжелый фьюнерал-дум с гораздо меньшим стремлением к запоминающимся песням и музыкальной доступности".(http://timetorock.ru/reviews/swallow-the-sun-songs-from-the-...)
25 января 2019 года вышел последний на данный момент альбом группы "When A Shadow Is Forced Into The Light". Альбом получился более мелодичным и позитивным по сравнению с другими работами группы.
